MiRTarBase - MiRTarBase

miRTarBase
Database.png
İçerik
AçıklamaDeneysel olarak doğrulanmış mikroRNA -hedef etkileşimleri (MTI'ler).
Veri tipleri
yakalanan
miRNA-hedef etkileşimleri
İletişim
Araştırma MerkeziUlusal Chiao Tung Üniversitesi
LaboratuvarBiyoinformatik ve Sistem Biyolojisi Enstitüsü
YazarlarSheng-Da Hsu
Birincil alıntıHsu ve ark. (2011)[1]
Yayın tarihi2013
Giriş
İnternet sitesihttp://miRTarBase.mbc.nctu.edu.tw/
URL'yi indirhttp://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/php/download.php
Çeşitli
Sürüm4.5

miRTarBase [1] küratörlü bir veritabanıdır MikroRNA-Hedef Etkileşimleri. Bir veritabanı olarak miRTarBase, miRNA'ların işlevsel çalışmalarıyla ilgili araştırma makalelerini sistematik olarak filtrelemek için metnin veri madenciliğinden sonra ilgili literatürü manuel olarak tarayarak toplanan elli binden fazla miRNA-hedef etkileşimi (MTI) biriktirmiştir. Genel olarak, toplanan MTI'lar raportör analizi, western blot, mikrodizi ve yeni nesil sıralama deneyleri ile deneysel olarak doğrulanır. MiRTarBase, doğrulanmış en büyük MTI miktarını içerirken, diğer benzer, önceden geliştirilmiş veritabanları ile karşılaştırarak en güncel koleksiyonu sağlar.

miRTarBase iyileştirmeleri

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ a b Hsu SD, Lin FM, Wu WY, Liang C, Huang WC, Chan WL, Tsai WT, Chen GZ, Lee CJ, Chiu CM, Chien CH, Wu MC, Huang CY, Tsou AP, Huang HD (2011). "miRTarBase: bir veritabanı deneysel olarak doğrulanmış mikroRNA-hedef etkileşimlerini düzenler". Nükleik Asit Araştırması. 39 (Veritabanı sorunu): D163-9. doi:10.1093 / nar / gkq1107. PMC  3013699. PMID  21071411.

Dış bağlantılar