TRIM37 - TRIM37 - Wikipedia

TRIM37
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarTRIM37, MUL, POB1, TEF3, 37 içeren üçlü motif
Harici kimliklerOMIM: 605073 MGI: 2153072 HomoloGene: 9084 GeneCard'lar: TRIM37
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 17 (insan)
Chr.Kromozom 17 (insan)[1]
Kromozom 17 (insan)
TRIM37 için genomik konum
TRIM37 için genomik konum
Grup17q22Başlat58,982,638 bp[1]
Son59,106,921 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE TRIM37 213009 s fs.png'de
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_197987
NM_001363025
NM_001363026
NM_001363027
NM_001363028

RefSeq (protein)

NP_932104
NP_001349954
NP_001349955
NP_001349956
NP_001349957

Konum (UCSC)Tarih 17: 58.98 - 59.11 MbChr 11: 87.13 - 87.22 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

Üçlü motif içeren protein 37 bir E3 ubikuitin ligaz tarafından kodlanan insanlarda TRIM37 gen.[5][6][7][8]

Fonksiyon

Bu gen bir üyesini kodlar üçlü motif (TRIM) ailesi, üyeleri gelişimsel modelleme gibi çeşitli hücresel işlevlerde yer alır ve onkogenez. TRIM motifi şunları içerir: çinko bağlayıcı alanlar, bir HALKA parmak bölgesi, a B kutusu motifi ve bir sarmal bobin alanı. RING parmak ve B-box alanları çinkoyu şelatlaştırır ve protein-protein ve / veya protein-nükleik asit etkileşimlerinde rol oynayabilir. Gen mutasyonları şunlarla ilişkilidir: mulibrey (kas-karaciğer-beyin-göz) nanizm, otozomal resesif bir bozukluk olan ve çeşitli dokuları içeren mezodermal Menşei. Aynı proteini kodlayan alternatif olarak uç uca eklenmiş transkript varyantları tanımlanmıştır.[7] Mono-her yerde bulunma nın-nin histon H2A lizin 119, genel olarak transkripsiyonel baskı.[8][9]

Meme kanserinde rol

17q23 kromozom bölgesi TRIM37 genin yer aldığı meme kanserlerinin% 40'ına kadar çoğaldığı gösterilmiştir.[10] TRIM37 proteininin memede rol oynadığı düşünülmektedir. kanser onkogenezi Tümör baskılayıcı genlerin işgal ettiği bölgelerde histon H2A'nın ubikitinasyonu yoluyla. Tümör baskılayıcı genlerin bu baskılanması, bir tümörün oluşma veya mevcut bir tümörün daha agresif olma olasılığını artırır.[8]

Etkileşimler

TRIM37'nin gösterdiği etkileşim ile PRC1.[11] TRIM37'nin özgüllüğünü değiştirmek için PRC2 ile etkileşime girdiği ve ne zaman TRIM37 fazla ifade edildiğinde, tümör baskılayıcı genlerin susturulmasına yol açan gen ifadesinde birçok değişiklik vardır.[8] Ayrıca, TRIM37, PRC2, PRC1'in, hedef genlere birlikte bağlanmak için birlikte çalıştığı ve bunların transkripsiyonel baskılanmasıyla sonuçlandığı gösterilmiştir. Knockdown TRIM37 RNA interferansı yoluyla ekspresyonun, H2A'nın de-ubiquitine hale gelmesine ve PRC1 ve PRC2'nin hedef genlerden ayrılmasına neden olduğu gösterilmiştir. Bu değişiklikler, hedef genin transkripsiyonel olarak aktif olmasına izin verir.[8]

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000108395 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000018548 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ Avela K, Lipsanen-Nyman M, Perheentupa J, Wallgren-Pettersson C, Marchand S, Fauré S, ve diğerleri. (Nisan 1997). "Bağlantı ve bağlantı dengesizliği analizi ile mulibrey nanizm geninin 17q'ye atanması". Amerikan İnsan Genetiği Dergisi. 60 (4): 896–902. PMC  1712467. PMID  9106536.
  6. ^ Avela K, Lipsanen-Nyman M, Idänheimo N, Seemanová E, Rosengren S, Mäkelä TP, ve diğerleri. (Temmuz 2000). "Yeni bir RING-B-kutusu-Sarmal-bobin proteinini kodlayan gen, mulibrey nanizminde mutasyona uğradı". Doğa Genetiği. 25 (3): 298–301. doi:10.1038/77053. PMID  10888877. S2CID  24257747.
  7. ^ a b "Entrez Gene: TRIM37 üçlü motif içeren 37".
  8. ^ a b c d e Bhatnagar S, Gazin C, Chamberlain L, Ou J, Zhu X, Tushir JS, ve diğerleri. (Aralık 2014). "TRIM37, yeni bir histon H2A ubikuitin ligaz ve meme kanseri onkoproteinidir". Doğa. 516 (7529): 116–20. Bibcode:2014Natur.516..116B. doi:10.1038 / nature13955. PMC  4269325. PMID  25470042.
  9. ^ Weake VM, Workman JL (Mart 2008). "Histon ubikitinasyonu: gen aktivitesini tetikleme". Moleküler Hücre. 29 (6): 653–63. doi:10.1016 / j.molcel.2008.02.014. PMID  18374642.
  10. ^ Sinclair, Colleen S .; Rowley, Matthew; Naderi, Ali; Kanepe, Fergus J. (2003-04-01). "17q23 Amplikon ve Göğüs Kanseri". Meme Kanseri Araştırma ve Tedavisi. 78 (3): 313–322. doi:10.1023 / A: 1023081624133. ISSN  1573-7217. PMID  12755490. S2CID  23751525.
  11. ^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, ve diğerleri. (Ekim 2005). "İnsan protein-protein etkileşim ağının proteom ölçekli bir haritasına doğru". Doğa. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.

daha fazla okuma

Dış bağlantılar

  • Mevcut tüm yapısal bilgilere genel bakış PDB için UniProt: O94972 (E3 ubikuitin-protein ligaz TRIM37) PDBe-KB.