Yass (yazılım) - Yass (software)

YASS
Kararlı sürüm
1.14
Depo Bunu Vikiveri'de düzenleyin
İşletim sistemiLinux, Mac, MS-Windows
TürBiyoinformatik araç
LisansGPLv2 CeCILL
İnternet sitesihttps://bioinfo.cristal.univ-lille.fr/yass/

YASS[1][2] bir ücretsiz yazılım,[3] ikili sıra hizalama yazılımı için nükleotid diziler, yani, arasındaki benzerlikleri arayabilir DNA veya RNA diziler. YASS, nükleotid dizilerini düz metinde veya FAŞTA biçimi ve çıktı biçimi şunları içerir: ÜFLEME tablo çıktısı. YASS birkaç geçiş kısıtlamalı aralıklı tohum k-mers, önemli ölçüde geliştirilmiş hassasiyete izin verir. YASS, bir kullanıcının makinesinde yerel olarak veya SaaS üzerinde YASS web sunucusu, tarayıcı tabanlı bir nokta arsa.

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Noe L., Kucherov. G. (2005). "YASS: DNA benzerliği aramasının hassasiyetini artırma". Nükleik Asit Araştırması. 33 (2): W540 – W543. doi:10.1093 / nar / gki478. PMC  1160238. PMID  15980530.
  2. ^ Noe L., Kucherov. G. (2004). "DNA yerel hizalaması için iyileştirilmiş isabet kriterleri". BMC Biyoinformatik. 5: 149. doi:10.1186/1471-2105-5-149. PMC  526756. PMID  15485572.
  3. ^ "BENİOKU". Alındı 7 Nisan 2015.

Dış bağlantılar